Основні напрями роботи відділу:

• мікробіологічний контроль якості та безпечності ветеринарних препаратів і кормових добавок;
• дослідження чутливості мікроорганізмів до антимікробних речовин;
• проведення клінічних випробувань з вивченням терапевтичної ефективності ветеринарних хіміотерапевтичних препаратів та кормових добавок на цільових тваринах;
• визначення біоеквівалентності, залишкових кількостей ветеринарних препаратів у тканинах та органах цільових видів продуктивних тварин (в рамках проведення клінічних досліджень) і сировині;
• визначення якості та безпечності готових лікарських форм, субстанцій антимікробних препаратів, визначення їх вмісту у кормах.